Filtrando en el cuarto frío / Filtering in the cold room

(*Short English version at the end of the post)

Ayer fue nuestro último día de campo y hoy, en medio de las noticias del terremoto en Japón, pasamos gran parte del día filtrando las muestras (ya derretidas) en el cuarto frío. Shelly estaba a cargo de las muestras para conteos celulares y yo estaba a cargo de las muestras para polisacáridos. 

Filtrar en el cuarto frío implica pasar varias horas en un cuarto a unos cuantos grados bajo cero, midiendo volúmenes de muestra para colocarlos en una torre de filtración, esperar a que el volumen se filtre y luego colectar el filtro (que en el caso de los conteos celulares se fija directamente en una lámina) o el filtro y el filtrado (que se congelan y se analizan de regreso en Seattle).



Pasar tanto tiempo en el cuarto frío requiere una buena chaqueta, guantes y sombrero para evitar enfriarse demasiado. Yo, personalmente, he descubierto que es mejor llevar también las botas de campo.

A pesar del frío, sin embargo, filtrar a bajas temperaturas resulta muy importante para preservar los microorganismos que queremos observar. Varios de estos organismos son psicrófilos, es decir, pueden crecer a bajas temperaturas pero se mueren cuando son expuestos a temperatura ambiente. Por un lado, filtrar a bajas temperaturas disminuye la posibilidad que los microbios se multipliquen antes de que los colectemos en el filtro; por el otro, disminuye el riesgo de que los microbios se mueran antes de que podamos contarlos.

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Short English version

Yesterday was our last day in the field. Today, among the news of the earthquake in Japan, we spent most of the day filtering in the cold room. Shelly's on charge of samples for cell counts, I am in charge of samples for polysaccharides.

Cold room filtration demands a good pair of gloves, hat and a warm jacket. I've discovered that using the field boots is also a good idea.

In spite of the cold, filtering at low temperatures is important to maintain the quality of the sample. The microbes that we're studying are psycrophiles, that is, they grow at low temperatures but die at room temperature. Filtering at lower temperatures prevents, on one side, microbes from multiplying before we filter them out of the sample. On the other side, it prevents microbes from dying before we count them.